由利麟太郎是一個曾做過搜查一課長的名偵探。他頭腦清晰，非常優秀，被稱為“警視廳的那個人”，卻因某案件辭職。現在，他移居學生時代住過的京都，以經營古董店的波田聰美的房子為據點。立志成為推理小說作家的三津木俊尊稱由利為“老師”，并助成為他的助手。作為犯罪心理學者的由利帶著三津木活躍于業界，同時也接受警察的委托幫助調查案件。某天，由利收到了一封殺人預告的留言，來自一個名為“花骷髏”的人。俊助驚呼這是挑戰書。由利和俊助二人趕到指定的地點，在那發現了滴著血的冷凍庫。里面躺著的是，作為遺傳基因研究者被熟知的日下瑛造的養女日下瑠璃子。她全身被綁著，流著血，被關在里面。確認瑠璃子還有氣息后，由利報警并叫了救護車，然后趕往冷凍庫的持有人日下的家。接著，他們與由利的舊友京都府警等等力警部匯合。俊助看到二樓有人影閃過，他們就跑上二樓，在被認為是瑛造的兒子瑛一的房間里，發現了一件沾著達到致死血量的羽絨服外套。而在研究室里，日下尸體被發現了，他的胸前插著一把短刀，死狀甚是凄慘。由利注意到了遺體旁邊放著的，令人毛骨悚然的被血淋得鮮紅的頭蓋骨。