自從妮瑪跟蕾娜的事情公布于眾后，妮瑪就搬到了跟亞歷克斯一起住，并且告訴她只有學校的學員們不知道她們是雙胞胎的事情，米蘭達(安潔紐·艾莉絲 飾)跟奧康納以及學校的職工都知道。另一間房間內的西蒙也在跟蕾娜愉快的聊著天，一切都回到了正規上。　　亞歷克斯帶著受傷的瑞恩(杰克·麥克勞克林 飾)離開了FBI的包圍，兩人躲進了一間沒人居住的民房內，沒有任何手術經驗的亞歷克斯通過手跟刀子成功的將瑞恩腹中的子彈取了出來。另一邊的西蒙跟謝爾比(喬安娜·布拉迪 飾)也被FBI抓了起來。瑞恩跟亞歷克斯看著新聞中克萊頓的報道，這時克萊頓的郵件被人黑了進去，里面的眾多郵件都被公布到了網絡上。亞歷克斯覺得無論是誰幫的忙給了她所需要的一切去正面她的清白。　　FBI的人很快就找到了亞歷克斯跟瑞恩躲藏的小區，但是之前幫助過亞歷克斯的黑客前來幫助她并且希望能幫助亞歷克斯轉移到安全的地方，亞歷克斯覺得克萊頓泄露的郵件是個重要的信息，也許能幫助她洗脫清白。亞歷克斯在一些信用卡收據上看到了寫有她名字的收據，他們覺得也許紐約車站只是個幌子，也許還有其他的炸彈威脅。克萊頓告訴自己的兒子哈斯希望他幫助自己刪除一切郵件，兩人為此又因為謝爾比的事情鬧得不愉快，但是哈斯還是答應了父親的要求。　　九個月前，聯邦調查學院，瑞恩通過自己的關系網成功查出了亞歷克斯的父親原來是奧康納的上司，但是不懂什么原因奧康納申請了調離，亞歷克斯決定查出這背后的真相。娜塔莉覺得謝爾比跟哈斯發展太過迅速不好。　　米蘭達準備讓自己兒子跟著一起去調查學院。在學院內，米蘭達先是恭喜了學員們成功的通過了昨天的測試，并且公布了現在開始周末以及晚上允許學員們離開學院，但是在這同時他們還給每個學員都發布了一個案件，亞歷克斯負責的是“亞特蘭大疾控中心的炸彈威脅”，哈斯的則是“特區公園管理部門的員工數據庫被黑了”，西蒙的是“集團犯罪，牽涉到俄羅斯黑幫”。　　西蒙跟妮瑪發現了米蘭達給他們的案件都是有關聯的，米蘭達帶著眾人前往FBI的總部，讓他們在頂級特工面前匯報案件的進展。瑞恩因為本身就是特工因此有權限進入資料庫偷取了關于亞歷克斯父親的資料。學員們通過各自案件的聯系，成功的在FBI精英們的說出了各個案件直接的線索。　　但是任務還遠沒有結束，米蘭達跟奧康納等人將罪犯的照片交給了學員們，并且告訴他們不能引起恐慌不能被發現的情況下抓捕罪犯并且取回罪犯身上的病毒。亞歷克斯雖然最后成功的抓捕到了罪犯，但是卻不小心被罪犯的同伙將病毒放在了她的包里最后帶回了FBI總部，因此這次測試大家誰都沒通過。　　亞歷克斯發現之前跟瑞恩偷取的關于她父親的資料不翼而飛，她很是氣憤的扎到了奧康納，奧康納說出了當時在跟她父親一起執行任務的時候，因為他們的失誤導致她母親要替他們被黑鍋。　　亞歷克斯帶著受傷的瑞恩上了飛機，但是關鍵時候亞歷克斯卻借口回到了車內，原來她是希望先將受傷的瑞恩送走，自己則繼續留下追查真兇。